Триходерма образует устойчивые связи с живыми растениями, способствуя их росту и развитию. Она даже способна стимулировать заселение корней растений другими полезными микоризными грибами. С одной стороны, она может использоваться для ускорения разложения растительных остатков, что очень необходимо для компостирования и быстрого возврата питательных веществ в почву, а также для создания конкуренции тем патогенным микроорганизмам, которые отлично сохраняются на остатках растительности.